以蛋白质-核酸为代表的生物大分子间的相互作用在生命活动中具有重要的调控作用,氨基酸和核苷酸的结合方式和特征是相关分子机制的重要内容。研究氨基酸与核苷酸之间的相互作用是认识蛋白质-脱氧核糖核酸(DNA)和蛋白质-核糖核酸(RNA)相互识别本质的基础。为了认识氨基酸和脱氧核糖核苷酸之间相互作用原理的分子机制,探索蛋白质-核酸相互识别规律和本质,我们利用微球辅助的流式细胞术以及概率统计的基本原理,系统研究了4种脱氧核糖核苷酸和4种核糖核苷酸的同型寡核苷酸单链(ssDNA, ssRNA)与20种常见氨基酸的同型寡肽两两之间相互作用的平衡解离常数(KD)和结合自由能(ΔGA),建立了基于大样本量测量氨基酸与脱氧核糖核苷酸和核糖核苷酸相互作用热力学平衡常数的实验方法。 研究结果表明,氨基酸和核苷酸(脱氧核糖核苷酸和核糖核苷酸)之间相互作用原理包含以下内容: l 氨基酸-核苷酸相互作用是氢键主导的; l 氨基酸-核苷酸相互作用强度具有分立的聚类特征; l 每种氨基酸具有独特的核苷酸相互作用谱,反之亦然,即每种核苷酸具有独特的氨基酸相互作用谱。 这些研究将有助于认识氨基酸和核苷酸之间相互作用原理的分子机制,探索蛋白质-核酸相互识别规律和本质。 |